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Erschienen in:
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2011 | OriginalPaper | Buchkapitel

A New Genetic Algorithm Using Gap Matrixes for Multiple Sequence Alignment

verfasst von : Jin Zhang, Zhen Wang

Erschienen in: Advances in Information Technology and Education

Verlag: Springer Berlin Heidelberg

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As is well known, multiple sequence alignment (MSA) is a widely used technique in molecular sequence analysis, and the object of MSA is to find optimal alignment for several sequences. By using gap matrixes, this paper devised a new genetic algorithm to solve MSA problem, and the approach is examined by using a set of standard instances taken from the benchmark alignment database BAliBASE. Numerical simulations are performed to verify the significance of the proposed algorithm.

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Metadaten
Titel
A New Genetic Algorithm Using Gap Matrixes for Multiple Sequence Alignment
verfasst von
Jin Zhang
Zhen Wang
Copyright-Jahr
2011
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
Buch
Advances in Information Technology and Education

Print ISBN: 978-3-642-22417-1

Electronic ISBN: 978-3-642-22418-8

Copyright-Jahr: 2011

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-642-22418-8_33