Skip to main content
main-content

Tipp

Weitere Artikel dieser Ausgabe durch Wischen aufrufen

01.06.2015 | Ausgabe 2/2015

Journal of Computational Electronics 2/2015

A transport equation for confined structures applied to the OprP, Gramicidin A, and KcsA channels

Zeitschrift:
Journal of Computational Electronics > Ausgabe 2/2015
Autoren:
Amirreza Khodadadian, Clemens Heitzinger

Abstract

A transport equation for confined structures is used to calculate the ionic currents through various transmembrane proteins. The transport equation is a diffusion-type equation where the concentration of the particles depends on the one-dimensional position in the confined structure and on the local energy. The computational significance of this continuum model is that the (6 + 1)-dimensional Boltzmann equation is reduced to a (2 + 1)-dimensional diffusion-type equation that can be solved with small computational effort so that ionic currents through confined structures can be calculated quickly. The applications here are three channels, namely OprP, Gramicidin A, and KcsA. In each case, the confinement potential is estimated from the known molecular structure of the channel. Then the confinement potentials are used to calculate ionic currents and to study the effect of parameters such as the potential of mean force, the ionic bath concentration, and the applied voltage. The simulated currents are compared with measurements, and very good agreement is found in each case. Finally, virtual potassium channels with selectivity filters of varying length are simulated in order to discuss the optimality of the filter.

Bitte loggen Sie sich ein, um Zugang zu diesem Inhalt zu erhalten

Sie möchten Zugang zu diesem Inhalt erhalten? Dann informieren Sie sich jetzt über unsere Produkte:

Springer Professional "Wirtschaft+Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft+Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 69.000 Bücher
  • über 500 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Umwelt
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Maschinenbau + Werkstoffe
  • Versicherung + Risiko

Testen Sie jetzt 30 Tage kostenlos.

Springer Professional "Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 50.000 Bücher
  • über 380 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Umwelt
  • Maschinenbau + Werkstoffe




Testen Sie jetzt 30 Tage kostenlos.

Springer Professional "Wirtschaft"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 58.000 Bücher
  • über 300 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Versicherung + Risiko




Testen Sie jetzt 30 Tage kostenlos.

Literatur
Über diesen Artikel

Weitere Artikel der Ausgabe 2/2015

Journal of Computational Electronics 2/2015 Zur Ausgabe