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2006 | OriginalPaper | Buchkapitel

Algorithms on Extended (δ, γ)-Matching

verfasst von : Inbok Lee, Raphaël Clifford, Sung-Ryul Kim

Erschienen in: Computational Science and Its Applications - ICCSA 2006

Verlag: Springer Berlin Heidelberg

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Approximate pattern matching plays an important role in various applications, such as bioinformatics, computer-aided music analysis and computer vision. We focus on (

δ

,

γ

)-matching. Given a text

T

of length

n

, a pattern

P

of length

m

,and two parameters

δ

and

γ

, the aim is to find all the substring

T

[

i

,

i

+

m

–1] such that (a) ∀ 1 ≤

j

m

, |

T

[

i

+

j

–1] –

P

[

j

]| ≤

δ

(

δ

-matching) , and (b) ∑

1 ≤ j ≤ m

|

T

[

i

+

j

–1] –

P

[

j

]| ≤

γ

(

γ

-matching). In this paper we consider three variations of (

δ

,

γ

)-matching:

amplified matching

,

transposition-invariant matching

, and

amplified transposition-invariant matching

. For each problem we propose a simple and efficient algorithm which is easy to implement.

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Metadaten
Titel
Algorithms on Extended (δ, γ)-Matching
verfasst von
Inbok Lee
Raphaël Clifford
Sung-Ryul Kim
Copyright-Jahr
2006
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
DOI
https://doi.org/10.1007/11751595_119