Skip to main content
Fachgebiete
Automobil + Motoren Bauwesen + Immobilien Business IT + Informatik Elektrotechnik + Elektronik Energie + Nachhaltigkeit Finance + Banking Management + Führung Marketing + Vertrieb Maschinenbau + Werkstoffe Versicherung + Risiko
DE
EN
Bücher
Zeitschriften
Themenseiten
Organisationspsychologie Projektmanagement Marketing Smart Manufacturing
Weitere Formate
Podcasts Webinare Technik Webinare Wirtschaft Kongresse Veranstaltungskalender Awards
Jetzt Einzelzugang starten
Zugang für Unternehmen
Referenzkunden
SLX-Digitalkonferenz: Zukunftswerkstatt 2024

Mehr Umsatz mit Top-Kontakten

Am 7. Mai erfahren Sie, wie Vertriebsteams Leadgenerierung, Leadnurturing und Leadstrategien effizient steuern können.
Erweiterte Suche
Anmelden
nach oben
Erschienen in:
On a Coexisting Scheme for Multiple Flows in Multi-radio Multi-channel Wireless Mesh Networks Kapitel lesen Erstes Kapitel lesen

2020 | OriginalPaper | Buchkapitel

An Improved Algorithm for Building Suffix Array in External Memory

verfasst von : Yi Wu, Bin Lao, Xinghui Ma, Ge Nong

Erschienen in: Parallel Architectures, Algorithms and Programming

Verlag: Springer Singapore

Einloggen

Aktivieren Sie unsere intelligente Suche, um passende Fachinhalte oder Patente zu finden.

search-config
loading …

Abstract

A suffix array (SA) is a data structure that has been widely used in many string processing applications, and it can be built on external memory model using the induced sorting (IS) method when the size of input and output exceeds the capacity of internal memory. In this paper, we make our first attempt to improve the performance of DSA-IS using new substring sorting and naming methods in the reduction phase. The experimental results indicate that, our program for the adapted algorithm DSA-IS+ runs as fast as eSAIS and consumes only half as much disk space as the latter on various real-world datasets.

Sie haben noch keine Lizenz? Dann Informieren Sie sich jetzt über unsere Produkte:

Springer Professional "Wirtschaft+Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft+Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 102.000 Bücher
  • über 537 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Nachhaltigkeit
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Maschinenbau + Werkstoffe
  • Versicherung + Risiko

Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Jetzt informieren

Springer Professional "Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 67.000 Bücher
  • über 390 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Nachhaltigkeit
  • Maschinenbau + Werkstoffe




 

Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Jetzt informieren

Springer Professional "Wirtschaft"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 67.000 Bücher
  • über 340 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Versicherung + Risiko




Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Jetzt informieren
Vorheriges Kapitel GPU-Accelerated Parallel Aligning Long Reads with High Error Rate Using Enhanced Sparse Suffix Array
Nächstes Kapitel In-Place Suffix Sorting on a Multicore Computer with Better Design
Literatur
1.
Abouelhodaa, M., Kurtzb, S., Ohlebuscha, E.: Replacing suffix trees with enhanced suffix arrays. J. Discrete Algorithms 2(1), 53–86 (2004)MathSciNetCrossRef
2.
Bingmann, T., Fischer, J., Osipov, V.: Inducing suffix and LCP arrays in external memory. In: Proceedings of the 15th Workshop on Algorithm Engineering and Experiments, pp. 88–102 (2012)CrossRef
3.
Dementiev, R., Kärkäinen, J., Mehnert, J., Sanders, P.: Better external memory suffix array construction. ACM J. Exp. Algorithmics 12(3), 4:1–4:24 (2008)MathSciNetMATH
4.
Ferragina, P., Gagie, T., Manzini, G.: Lightweight data indexing and compression in external memory. Algorithmica 63(3), 707–730 (2012)MathSciNetCrossRef
5.
Kärkkäinen, J., Kempa, D.: Engineering a lightweight external memory suffix array construction algorithm. In: Proceedings of the 2nd International Conference on Algorithms for Big Data, Palermo, Italy, pp. 53–60 (2014)
6.
7.
8.
Manber, U., Myers, G.: Suffix arrays: a new method for on-line string searches. SIAM J. Comput. 22(5), 935–948 (1993)MathSciNetCrossRef
9.
Nong, G., Chan, W.H., Hu, S.Q., Wu, Y.: Induced sorting suffixes in external memory. ACM Trans. Inf. Syst. 33(3), 12:1–12:15 (2015)CrossRef
10.
Nong, G., Chan, W.H., Zhang, S., Guan, X.F.: Suffix array construction in external memory using D-critical substrings. ACM Trans. Inf. Syst. 32(1), 1:1–1:15 (2014)CrossRef
11.
Nong, G., Zhang, S., Chan, W.H.: Two efficient algorithms for linear time suffix array construction. IEEE Trans. Comput. 60(10), 1471–1484 (2011)MathSciNetCrossRef
Metadaten
Titel
An Improved Algorithm for Building Suffix Array in External Memory
verfasst von
Yi Wu
Bin Lao
Xinghui Ma
Ge Nong
Copyright-Jahr
2020
Verlag
Springer Singapore
Buch
Parallel Architectures, Algorithms and Programming

Print ISBN: 978-981-15-2766-1

Electronic ISBN: 978-981-15-2767-8

Copyright-Jahr: 2020

DOI
https://doi.org/10.1007/978-981-15-2767-8_29

Neuer Inhalt

    Bildnachweise