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Erschienen in:
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2019 | OriginalPaper | Buchkapitel

Bringing Open Data to Whole Slide Imaging

verfasst von : Sébastien Besson, Roger Leigh, Melissa Linkert, Chris Allan, Jean-Marie Burel, Mark Carroll, David Gault, Riad Gozim, Simon Li, Dominik Lindner, Josh Moore, Will Moore, Petr Walczysko, Frances Wong, Jason R. Swedlow

Erschienen in: Digital Pathology

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

Faced with the need to support a growing number of whole slide imaging (WSI) file formats, our team has extended a long-standing community file format (OME-TIFF) for use in digital pathology. The format makes use of the core TIFF specification to store multi-resolution (or “pyramidal”) representations of a single slide in a flexible, performant manner. Here we describe the structure of this format, its performance characteristics, as well as an open-source library support for reading and writing pyramidal OME-TIFFs.

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Literatur
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Metadaten
Titel
Bringing Open Data to Whole Slide Imaging
verfasst von
Sébastien Besson
Roger Leigh
Melissa Linkert
Chris Allan
Jean-Marie Burel
Mark Carroll
David Gault
Riad Gozim
Simon Li
Dominik Lindner
Josh Moore
Will Moore
Petr Walczysko
Frances Wong
Jason R. Swedlow
Copyright-Jahr
2019
Buch
Digital Pathology

Print ISBN: 978-3-030-23936-7

Electronic ISBN: 978-3-030-23937-4

Copyright-Jahr: 2019

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-030-23937-4_1