Cell Segmentation in Quantitative Phase Images with Improved Iterative Thresholding Method

Quantitative Phase Imaging (QPI) ist eine markierungsfreie mikroskopische Technik, die Bilder mit hohem Kontrast liefert und darüber hinaus quantitative Zellmassenmessungen für jeden Pixel ermöglicht. Die Segmentierung bestimmter Zellen ist ein wichtiger Schritt bei der Analyse von QPI-Bilddaten. Diese Arbeit präsentiert eine Methode zur automatischen Zellsegmentierung in QPI-Bildern. Die vorgeschlagene Methode verbessert die iterative Schwelle, die eine sehr vielversprechende Methode ist, aber nicht in der Lage, dicht geclusterte Zellen zu segmentieren. Unsere verbesserte iterative Schwelle umfasst zwei zusätzliche Schritte - Laplacian of Gaußsche Bildverbesserung und entfernungstransformbasierte Spaltung. Die Methode wurde mit der ursprünglichen iterativen Schwelle und einer weiteren Methode auf zwei Zelllinien verglichen, bei der die vorgeschlagene Methode erfolgreich einen dicht geclusterten Zelltyp behandelt und signifikant bessere Ergebnisse auf beiden Datensätzen erzielt.