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Erschienen in:
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2015 | OriginalPaper | Buchkapitel

Changes in Codon-Pair Bias of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Affect Virus Replication

verfasst von : Miguel Ángel Martínez

Erschienen in: Extended Abstracts Spring 2014

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

The standard genetic code consists of 64 codons for a set of 20 amino acids and the stop signal, showing its redundancy (except for tryptophan and methionine) and implying that several synonymous triplets encode for the same amino acid. Usually, the position of such synonymous codons is not constant along the protein coding sequences and therefore, their properties are not entirely comparable. Relative amounts of tRNAs iso-acceptors have been associated to codon usage patterns in different organisms. Codon usage bias, the frequency of occurrence of synonymous codons in coding DNA, in human cells is limited by amino acids needed for protein structure/function and by genome signatures (dinucleotide relative abundances). In contrast, translational and transcriptional influences appear to play a minor role in human codon usage [5].

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Literatur
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Metadaten
Titel
Changes in Codon-Pair Bias of Human Immunodeficiency Virus Type 1 Affect Virus Replication
verfasst von
Miguel Ángel Martínez
Copyright-Jahr
2015
Buch
Extended Abstracts Spring 2014

Print ISBN: 978-3-319-22128-1

Electronic ISBN: 978-3-319-22129-8

Copyright-Jahr: 2015

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-22129-8_23