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Erschienen in:
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2014 | OriginalPaper | Buchkapitel

ConQuR-Bio: Consensus Ranking with Query Reformulation for Biological Data

verfasst von : Bryan Brancotte, Bastien Rance, Alain Denise, Sarah Cohen-Boulakia

Erschienen in: Data Integration in the Life Sciences

Verlag: Springer International Publishing

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This paper introduces ConQuR-Bio which aims at assisting scientists when they query public biological databases. Various reformulations of the user query are generated using medical terminologies. Such alternative reformulations are then used to rank the query results using a new consensus ranking strategy. The originality of our approach thus lies in using

consensus ranking

techniques within the context of

query reformulation

. The ConQuR-Bio system is able to query the EntrezGene NCBI database. Our experiments demonstrate the benefit of using ConQuR-Bio compared to what is currently provided to users. ConQuR-Bio is available to the bioinformatics community at

http://conqur-bio.lri.fr

.

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Metadaten
Titel
ConQuR-Bio: Consensus Ranking with Query Reformulation for Biological Data
verfasst von
Bryan Brancotte
Bastien Rance
Alain Denise
Sarah Cohen-Boulakia
Copyright-Jahr
2014
Verlag
Springer International Publishing
Buch
Data Integration in the Life Sciences

Print ISBN: 978-3-319-08589-0

Electronic ISBN: 978-3-319-08590-6

Copyright-Jahr: 2014

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-08590-6_13