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Erschienen in:
2001 | OriginalPaper | Buchkapitel
Einfache Alignments
verfasst von : Andrea Hansen
Erschienen in: Bioinformatik
Verlag: Birkhäuser Basel
Enthalten in: Professional Book Archive
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Alignments sind die Grundlage aller Sequenzanalysen. Das einfachste Alignment besteht aus zwei Sequenzen, die aufgrund der Position ihrer Nukleotide bzw. Aminosäuren aneinander ausgerichtet werden. Ziel ist es dabei, möglichst viele identische Positionen nebeneinander in den zu vergleichenden Sequenzen zu finden. Der Dotplot, das globale und das lokale Alignment gehören zu den gängigsten Methoden dieser Analyse. Die Bewertung des paarweisen Sequenzvergleichs erfolgt mit Hilfe einer Substitutionsmatrix.