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2013 | OriginalPaper | Chapter

Counting Motifs in the Entire Biological Network from Noisy and Incomplete Data

(Extended Abstract)

Authors : Ngoc Hieu Tran, Kwok Pui Choi, Louxin Zhang

Published in: Research in Computational Molecular Biology

Publisher: Springer Berlin Heidelberg

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Small over-represented motifs in biological networks are believed to represent essential functional units of biological processes. A natural question is to gauge whether a motif occurs abundantly or rarely in a biological network. Given that high-throughput biotechnology is only able to interrogate a portion of the entire biological network with non-negligible errors, we develop a powerful method to correct link errors in estimating undirected or directed motif counts in the entire network from noisy subnetwork data.

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Metadata
Title
Counting Motifs in the Entire Biological Network from Noisy and Incomplete Data
Authors
Ngoc Hieu Tran
Kwok Pui Choi
Louxin Zhang
Copyright Year
2013
Publisher
Springer Berlin Heidelberg
DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-642-37195-0_24

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