Da Altpapier ein lignocellulolytisches Substrat ist, stellt es eine Kohlenstoffquelle dar, die von Mikro-organismen genutzt werden kann. Besonders leicht sind die Kohlenhydrate aufschließbar. Eine Reihe von Mikroorganismen, darunter insbesondere Pilze, sind aber auch in der Lage, Lignin zu nutzen. An Beispielen soll gezeigt werden, wie eine mikrobielle Kontamination für Altpapiersubstrate zeitlich verläuft und welche technologischen Möglichkeiten es gibt, die Verkeimung zu kontrollieren.