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2014 | OriginalPaper | Chapter

Towards an Ensemble Learning Strategy for Metagenomic Gene Prediction

Authors : Fabiana Goés, Ronnie Alves, Leandro Corrêa, Cristian Chaparro, Lucinéia Thom

Published in: Advances in Bioinformatics and Computational Biology

Publisher: Springer International Publishing

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Metagenomics is an emerging field in which the power of genome analysis is applied to entire communities of microbes. A large variety of classifiers has been developed for gene prediction though there is lack of an empirical evaluation regarding the core machine learning techniques implemented in these tools. In this work we present an empirical performance evaluation of classification strategies for metagenomic gene prediction. This comparison takes into account distinct supervised learning strategies: one lazy learner, two eager-learners and one ensemble learner. Though the performance of the four base classifiers was good, the ensemble-based strategy with

Random Forest

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Metadata
Title
Towards an Ensemble Learning Strategy for Metagenomic Gene Prediction
Authors
Fabiana Goés
Ronnie Alves
Leandro Corrêa
Cristian Chaparro
Lucinéia Thom
Copyright Year
2014
Publisher
Springer International Publishing
DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-12418-6_3

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