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Erschienen in:
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2017 | OriginalPaper | Buchkapitel

Extending the Genomic Data Model and the Genometric Query Language with Domain Taxonomies

verfasst von : Eleonora Cappelli, Emanuel Weitschek

Erschienen in: Web Engineering

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

In bioinformatics and biology researchers annotate experimental data in many different ways. When other researchers need to query these data, they are typically unaware of the specificity of the annotations; often they encounter possible mismatches between the granularity of the query and the granularity of the annotations. In this work, we propose an extension of the Genomic Data Model and the GenoMetric Query Language (a well established framework for biomedical data), able to search, integrate, and extend genomic data. The extension is going to be performed through domain taxonomies and by considering many external ontologies and databases. An ad-hoc software system and query language will be implemented for the storage, management, search, retrieval, and integration of biomedical data.

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Metadaten
Titel
Extending the Genomic Data Model and the Genometric Query Language with Domain Taxonomies
verfasst von
Eleonora Cappelli
Emanuel Weitschek
Copyright-Jahr
2017
Buch
Web Engineering

Print ISBN: 978-3-319-60130-4

Electronic ISBN: 978-3-319-60131-1

Copyright-Jahr: 2017

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-60131-1_44