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2015 | OriginalPaper | Buchkapitel

87. Function Annotation of Proteins in Eriocheir sinensis Based on the Protein-Protein Interaction Network

verfasst von : Tong Hao, Ailing Yu, Bin Wang, Anan Liu, Jinsheng Sun

Erschienen in: The Proceedings of the Third International Conference on Communications, Signal Processing, and Systems

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

Eriocheir sinensis is a highly-commercial aquaculture species as an important aquatic product source. The protein-protein interaction network (PIN) of E. sinensis has been constructed based on the RNA transcriptional sequencing. Many unknown proteins exist in the PIN, which seriously restricts the further mechanism researches on regulation, immunity and development of E. sinensis. In this work, we predicted the functions of the unknown proteins in E. sinensis based on the modularity feature of the PIN. The functions of 677 (93 %) proteins were annotated. The analysis of ribosome module indicates that the annotation of proteins and modules provides important references to be studied in the further in vivo experiment as well as the biological capability of the E. sinensis PIN.

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Metadaten
Titel
Function Annotation of Proteins in Eriocheir sinensis Based on the Protein-Protein Interaction Network
verfasst von
Tong Hao
Ailing Yu
Bin Wang
Anan Liu
Jinsheng Sun
Copyright-Jahr
2015
Buch
The Proceedings of the Third International Conference on Communications, Signal Processing, and Systems

Print ISBN: 978-3-319-08990-4

Electronic ISBN: 978-3-319-08991-1

Copyright-Jahr: 2015

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-08991-1_87

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