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2018 | OriginalPaper | Buchkapitel

Image Segmentation and Object Extraction for Automatic Diatoms Classification

verfasst von : Emanuel Gutiérrez Lira, Fathallah Nouboud, Alain Chalifour, Yvon Voisin

Erschienen in: Image and Signal Processing

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

The diatoms are unicellular algae of great interest in paleontology, aquatic ecology, and forensic medicine, among others. Currently, there are more than 100 000 known species distributed in aquatic ecosystems. For that reason, there is a big interest in the automatic classification of diatom images, however, the preliminary process applied to isolate the diatom from the background is a complex task. In this paper, we propose a segmentation method and an object-extraction procedure to extract the diatom from the background. First, we binarize the image by searching the optimal threshold in the histogram based on its cumulative distribution function. Then we eliminate, under some spatial criteria, all regions other than those that could be part of the diatom. Afterwards, we construct the convex hull of all remaining components. Finally, from this first polygonal approximation, we construct the diatom contour by successive refinements of the convex hull shape.

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Literatur
1.
Zurück zum Zitat Siddour, A., Nouboud, F., Mammass, D., Chalifour, A., Campeau, S.: Classification des diatomées par les descripteurs de Fourier du contour. Spécial MCSEAI 2006, e-TI, Numéro 4 / Issue 4 (2007) Siddour, A., Nouboud, F., Mammass, D., Chalifour, A., Campeau, S.: Classification des diatomées par les descripteurs de Fourier du contour. Spécial MCSEAI 2006, e-TI, Numéro 4 / Issue 4 (2007)
2.
Zurück zum Zitat Jalba, A.C., Wilkinson, M.H.F., Roerdink, J.B.T.M.: Automatic segmentation of diatom images for classification. Microsc. Res. Tech. 65, 72–85 (2004)CrossRef Jalba, A.C., Wilkinson, M.H.F., Roerdink, J.B.T.M.: Automatic segmentation of diatom images for classification. Microsc. Res. Tech. 65, 72–85 (2004)CrossRef
3.
Zurück zum Zitat Álvarez, T., Martín, Y., Pérez, S., Santos, F., Tadeo, F., González, S., Arribas, J.L., Vega, P.: Classification of microorganisms using image processing techniques. In: Proceedings of International Conference on Image Processing (Greece), pp. 329–332 (2001) Álvarez, T., Martín, Y., Pérez, S., Santos, F., Tadeo, F., González, S., Arribas, J.L., Vega, P.: Classification of microorganisms using image processing techniques. In: Proceedings of International Conference on Image Processing (Greece), pp. 329–332 (2001)
4.
Zurück zum Zitat Ciobanu, A., Shahbazkia, H., du Buf, H.: Contour profiling by dynamic ellipse fitting. In: Proceedings of 15th International Conference on Pattern Recognition, pp. 750–753 (2000) Ciobanu, A., Shahbazkia, H., du Buf, H.: Contour profiling by dynamic ellipse fitting. In: Proceedings of 15th International Conference on Pattern Recognition, pp. 750–753 (2000)
5.
Zurück zum Zitat Anjos, A., Shahbazkia, H.: Bi-level image thresholding - a fast method. In: Biosignals, pp. 70–76 (2008) Anjos, A., Shahbazkia, H.: Bi-level image thresholding - a fast method. In: Biosignals, pp. 70–76 (2008)
6.
Zurück zum Zitat Otsu, N.: A threshold selection method from gray-level histograms. IEEE Trans. Syst. Man Cybern. 9, 62–66 (1979)CrossRef Otsu, N.: A threshold selection method from gray-level histograms. IEEE Trans. Syst. Man Cybern. 9, 62–66 (1979)CrossRef
7.
Zurück zum Zitat Rosin, P.L.: Unimodal thresholding. J. Pattern Recognit. Soc. 34, 2083–2096 (2001)CrossRef Rosin, P.L.: Unimodal thresholding. J. Pattern Recognit. Soc. 34, 2083–2096 (2001)CrossRef
8.
Zurück zum Zitat Barber, C.B., Dobkin, D.P., Huhdanpaa, H.: The quickhull algorithm for convex hulls. ACM Trans. Math. Softw. 22, 469–483 (1996)MathSciNetCrossRef Barber, C.B., Dobkin, D.P., Huhdanpaa, H.: The quickhull algorithm for convex hulls. ACM Trans. Math. Softw. 22, 469–483 (1996)MathSciNetCrossRef
Metadaten
Titel
Image Segmentation and Object Extraction for Automatic Diatoms Classification
verfasst von
Emanuel Gutiérrez Lira
Fathallah Nouboud
Alain Chalifour
Yvon Voisin
Copyright-Jahr
2018
DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-94211-7_7