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Erschienen in:
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2016 | OriginalPaper | Buchkapitel

Intermediate Notation for Provenance and Workflow Reproducibility

verfasst von : Danius T. Michaelides, Richard Parker, Chris Charlton, William J. Browne, Luc Moreau

Erschienen in: Provenance and Annotation of Data and Processes

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

We present a technique to capture retrospective provenance across a number of tools in a statistical software suite. Our goal is to facilitate portability of processes between the tools to enhance usability and to support reproducibility. We describe an intermediate notation to aid runtime capture of provenance and demonstrate conversion to an executable and editable workflow. The notation is amenable to conversion to PROV via a template expansion mechanism. We discuss the impact on our system of recording this intermediate notation in terms of runtime performance and also the benefits it brings.

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Fußnoten
3
We generate UUIDs and use the urn:uuid: scheme.
 
Literatur
1.
Stodden, V., Leisch, F., Peng, R.D.: Implementing Reproducible Research. CRC Press, Boca Raton (2014)
2.
Yang, H., Michaelides, D.T., Charlton, C., Browne, W.J., Moreau, L.: DEEP: a provenance-aware executable document system. In: Groth, P., Frew, J. (eds.) IPAW 2012. LNCS, vol. 7525, pp. 24–38. Springer, Heidelberg (2012)CrossRef
3.
Wolstencroft, K., Haines, R., Fellows, D., Williams, A., Withers, D., Owen, S., Soiland-Reyes, S., Dunlop, I., Nenadic, A., Fisher, P., Bhagat, J., Belhajjame, K., Bacall, F., Hardisty, A., Nieva de la Hidalga, A., Balcazar Vargas, M.P., Sufi, S., Goble, C.: The Taverna workflow suite: designing and executing workflows of web services on the desktop, web or in the cloud. Nucleic Acids Res. 41(W1), W557–W561 (2013)CrossRef
4.
Ludäscher, B., Altintas, I., Berkley, C., Higgins, D., Jaeger, E., Jones, M., Lee, E.A., Tao, J., Zhao, Y.: Scientific workflow management and the Kepler system. Concurrency Comput. Pract. Exp. 18(10), 1039–1065 (2006)CrossRef
5.
Callahan, S.P., Freire, J., Santos, E., Scheidegger, C.E., Silva, C.T., Vo, H.T.: VisTrails: visualization meets data management. In: Proceedings of the 2006 ACM SIGMOD International Conference on Management of Data, SIGMOD 2006, pp. 745–747. ACM, New York (2006)
6.
McPhillips, T., Song, T., Kolisnik, T., Aulenbach, S., Belhajjame, K., Bocinsky, R., Cao, Y., Cheney, J., Chirigati, F., Dey, S., Freire, J., Jones, C., Hanken, J., Kintigh, K.W., Kohler, T.A., Koop, D., Macklin, J.A., Missier, P., Schildhauer, M., Schwalm, C., Wei, Y., Bieda, M., Ludäscher, B.: YesWorkflow: a user-oriented, language-independent tool for recovering workflow information from scripts. Int. J. Digital Curation 10(1), 298–313 (2015)CrossRef
7.
Chirigati, F., Shasha, D., Freire, J.: ReproZip: using provenance to support computational reproducibility. In: Presented as part of the 5th USENIX Workshop on the Theory and Practice of Provenance, Berkeley, CA. USENIX (2013)
8.
Moreau, L.: Provenance-based reproducibility in the semantic web. Web Semant. Sci. Serv. Agents World Wide Web 9(2), 202–221 (2011)CrossRef
9.
10.
11.
Missier, P., Dey, S., Belhajjame, K., Cuevas-Vicenttin, V., Ludäscher, B.: D-PROV: extending the PROV provenance model with workflow structure. In: 5th USENIX Workshop on the Theory and Practice of Provenance (TaPP 2013), Lombard, IL. USENIX Association, April 2013
12.
13.
Moreau, L., Missier, P.: PROV-DM: The PROV data model. World Wide Web Consortium, Recommendation REC-prov-dm-20130430, April 2013
14.
Freire, J., Koop, D., Santos, E., Silva, C.T.: Provenance for computational tasks: a survey. Comput. Sci. Eng. 10(3), 11–21 (2008)CrossRef
15.
Murta, L., Braganholo, V., Chirigati, F., Koop, D., Freire, J.: noWorkflow: capturing and analyzing provenance of scripts. In: Ludaescher, B., Plale, B. (eds.) IPAW 2014. LNCS, vol. 8628, pp. 71–83. Springer, Heidelberg (2015)CrossRef
16.
Simmhan, Y., Groth, P., Moreau, L.: The third provenance challenge on using the open provenance model for interoperability. Future Gener. Comput. Syst. 27(6), 737–742 (2011)CrossRef
17.
Missier, P., Goble, C.: Workflows to open provenance graphs, round-trip. Future Gener. Comput. Syst. 27(6), 812–819 (2011)CrossRef
18.
Cheney, J.: Program slicing and data provenance. IEEE Data Eng. Bull. 30(4), 22–28 (2007)
Metadaten
Titel
Intermediate Notation for Provenance and Workflow Reproducibility
verfasst von
Danius T. Michaelides
Richard Parker
Chris Charlton
William J. Browne
Luc Moreau
Copyright-Jahr
2016
Buch
Provenance and Annotation of Data and Processes

Print ISBN: 978-3-319-40592-6

Electronic ISBN: 978-3-319-40593-3

Copyright-Jahr: 2016

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-40593-3_7