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Erschienen in:

2020 | OriginalPaper | Buchkapitel

Na/K-ATPase Glutathionylation: in silico Modeling of Reaction Mechanisms

verfasst von : Yaroslav V. Solovev, Daria S. Ostroverkhova, Gaik Tamazian, Anton V. Domnin, Anastasya A. Anashkina, Irina Yu. Petrushanko, Eugene O. Stepanov, Yu. B. Porozov

Erschienen in: Bioinformatics Research and Applications

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

Na,K-ATPase is a redox-sensitive transmembrane protein. Understanding the mechanisms of Na,K-ATPase redox regulation can help to prevent impairment of Na,K-ATPase functioning under pathological conditions and reduce damage and death of cells. One of the basic mechanisms to protect Na,K-ATPase against stress oxidation is the glutathionylation reaction that is aimed to reduce several principal oxidized cysteines (244, 458, and 459) that are involved in Na,K-ATPase action regulation. In this study, we carried out in silico modeling to evaluate glutathione affinity on various stages of Na,K-ATPase action cycle, as well as to discover a reaction mechanism of disulfide bond formation between reduced glutathione and oxidized cysteine. To achieve this goal both glutathione and Na,K-ATPase conformer sampling was applied, the reliability of the protein-ligand complexes was examined by MD assay, the reaction mechanism was studied using semi-empirical PM6-D3H4 approach that could have a deal with large organic systems optimization.

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Titel: Na/K-ATPase Glutathionylation: in silico Modeling of Reaction Mechanisms
verfasst von: Yaroslav V. Solovev
Daria S. Ostroverkhova
Gaik Tamazian
Anton V. Domnin
Anastasya A. Anashkina
Irina Yu. Petrushanko
Eugene O. Stepanov
Yu. B. Porozov
Verlag: Springer International Publishing
Buch: Bioinformatics Research and Applications
Print ISBN: 978-3-030-57820-6

Electronic ISBN: 978-3-030-57821-3

Copyright-Jahr: 2020
DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-030-57821-3_36

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Abstract

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