Phylogenetische Bäume

Eine wesentliche Fragestellung in der Biologie ist die Rekonstruktion von Verwandtschaftsbeziehungen innerhalb einer gegebenen Menge biologischer Objekte. Bei diesen Objekten kann es sich zum Beispiel um verschiedene biologische Arten oder auch um einzelne Gene handeln. In diesem Zusammenhang bezeichnet man solche Objekte meist als Taxa1. Der am häufigsten verfolgte Ansatz zur Bestimmung von Verwandtschaftsbeziehungen ist die Konstruktion eines so genannten phylogenetischen Baums, kurz auch Phylogenie genannt. Hierbei handelt es sich um einen Baum, in dem jedem Blatt genau eines der Taxa zugeordnet ist, und dessen innere Knoten hypothetische Vorfahren dieser Taxa repräsentieren, so dass der Abstand zweier Taxa in diesem Baum einem Maß für die Verwandtschaft dieser zwei Taxa entspricht.