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01.01.2015 | Software Original Article | Ausgabe 1/2015 Open Access

Neuroinformatics 1/2015

POAS4SPM: A Toolbox for SPM to Denoise Diffusion MRI Data

Zeitschrift:
Neuroinformatics > Ausgabe 1/2015
Autoren:
Karsten Tabelow, Siawoosh Mohammadi, Nikolaus Weiskopf, Jörg Polzehl
Wichtige Hinweise
Karsten Tabelow and Siawoosh Mohammadi contributed equally to this paper.

Abstract

We present an implementation of a recently developed noise reduction algorithm for dMRI data, called multi-shell position orientation adaptive smoothing (msPOAS), as a toolbox for SPM. The method intrinsically adapts to the structures of different size and shape in dMRI and hence avoids blurring typically observed in non-adaptive smoothing. We give examples for the usage of the toolbox and explain the determination of experiment-dependent parameters for an optimal performance of msPOAS.

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