Skip to main content
main-content

Tipp

Weitere Artikel dieser Ausgabe durch Wischen aufrufen

01.01.2014 | Ausgabe 1/2014

Journal of Combinatorial Optimization 1/2014

Radiation hybrid map construction problem parameterized

Zeitschrift:
Journal of Combinatorial Optimization > Ausgabe 1/2014
Autoren:
Chihao Zhang, Haitao Jiang, Binhai Zhu

Abstract

In this paper, we study the Radiation hybrid map construction (\(\mathsf{{RHMC} }\)) problem which is about reconstructing a genome from a set of gene clusters. The problem is known to be \(\mathsf{{NP} }\)-complete even when all gene clusters are of size two and the corresponding problem (\(\mathsf{{RHMC}_2 }\)) admits efficient constant-factor approximation algorithms. In this paper, for the first time, we consider the more general case when the gene clusters can have size either two or three (\(\mathsf{{RHMC}_3 }\)). Let \({p\text{- }\mathsf {RHMC} }\) be a parameterized version of \(\mathsf{{RHMC} }\) where the parameter is the size of solution. We present a linear kernel for \({p\text{- }\mathsf {RHMC}_3 }\) of size \(22k\) that when combined with a bounded search-tree algorithm, gives an FPT algorithm running in \(O(6^kk+n)\) time. For \({p\text{- }\mathsf {RHMC}_3 }\) we present a bounded search tree algorithm which runs in \(O^*(2.45^k)\) time, greatly improving the previous bound using weak kernels.

Bitte loggen Sie sich ein, um Zugang zu diesem Inhalt zu erhalten

Sie möchten Zugang zu diesem Inhalt erhalten? Dann informieren Sie sich jetzt über unsere Produkte:

Springer Professional "Wirtschaft+Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft+Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 69.000 Bücher
  • über 500 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Umwelt
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Maschinenbau + Werkstoffe
  • Versicherung + Risiko

Testen Sie jetzt 30 Tage kostenlos.

Springer Professional "Wirtschaft"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 58.000 Bücher
  • über 300 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Versicherung + Risiko




Testen Sie jetzt 30 Tage kostenlos.

Springer Professional "Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 50.000 Bücher
  • über 380 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Umwelt
  • Maschinenbau + Werkstoffe




Testen Sie jetzt 30 Tage kostenlos.

Literatur
Über diesen Artikel

Weitere Artikel der Ausgabe 1/2014

Journal of Combinatorial Optimization 1/2014 Zur Ausgabe

EditorialNotes

Preface

Premium Partner

    Bildnachweise