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Reducing Boolean Networks with Backward Boolean Equivalence

  • 2021
  • OriginalPaper
  • Buchkapitel
Erschienen in:
Verfasst von
Georgios Argyris
Alberto Lluch Lafuente
Mirco Tribastone
Max Tschaikowski
Andrea Vandin
Erschienen in
Computational Methods in Systems Biology
Verlag
Springer International Publishing

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Abstract

Das Kapitel stellt eine neue Methode vor, die Backward Boolean Equivalence (BBE), um Boolesche Netzwerke (BNs) zu verringern und dabei Verhaltensweisen von Interesse genau zu erhalten. BBE kollabiert rückwärts Boolesche äquivalente Variablen, was die Reduktion von BNs ermöglicht, ohne falsche Flugbahnen oder Attraktoren zu erzeugen. Die Methode wird im frei verfügbaren Tool ERODE implementiert und auf einem großen Repository von BNs validiert, was eine deutliche Verringerung des staatlichen Raums und der Recheneffizienz zeigt. Das Kapitel enthält auch Fallstudien und Vergleiche mit anderen Reduktionstechniken, wobei die Wirksamkeit und Skalierbarkeit von BBE hervorgehoben wird.
KI-Generiert

Diese Zusammenfassung des Fachinhalts wurde mit Hilfe von KI generiert.

Partially supported by the DFF project REDUCTO 9040-00224B, the Poul Due Jensen Foundation grant 883901, and the PRIN project SEDUCE 2017TWRCNB.

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Titel
Reducing Boolean Networks with Backward Boolean Equivalence
Verfasst von
Georgios Argyris
Alberto Lluch Lafuente
Mirco Tribastone
Max Tschaikowski
Andrea Vandin
Copyright-Jahr
2021
Buch
Computational Methods in Systems Biology

Print ISBN: 978-3-030-85632-8

Electronic ISBN: 978-3-030-85633-5

Copyright-Jahr: 2021

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-030-85633-5_1
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