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2019 | OriginalPaper | Buchkapitel

Semi-Automatic Cell Correspondence Analysis Using Iterative Point Cloud Registration

verfasst von : Shuqing Chen, Simone Gehrer, Sara Kaliman, Nishant Ravikumar, Abdurrahman Becit, Maryam Aliee, Diana Dudziak, Rudolf Merkel, Ana-Sunćana Smith, Andreas Maier

Erschienen in: Bildverarbeitung für die Medizin 2019

Verlag: Springer Fachmedien Wiesbaden

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In the field of biophysics, deformation of in-vitro model tissues is an experimental technique to explore the response of tissue to a mechanical stimulus. However, automated registration before and after deformation is an ongoing obstacle for measuring the tissue response on the cellular level. Here, we propose to use an iterative point cloud registration (IPCR) method, for this problem. We apply the registration method on point clouds representing the cellular centers of mass, which are evaluated with aWatershed based segmentation of phase-contrast images of living tissue, acquired before and after deformation. Preliminary evaluation of this method on three data sets shows high accuracy, with 82% - 92% correctly registered cells, which outperforms coherent point drift (CPD). Hence, we propose the application of the IPCR method on the problem of cell correspondence analysis.

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Metadaten
Titel
Semi-Automatic Cell Correspondence Analysis Using Iterative Point Cloud Registration
verfasst von
Shuqing Chen
Simone Gehrer
Sara Kaliman
Nishant Ravikumar
Abdurrahman Becit
Maryam Aliee
Diana Dudziak
Rudolf Merkel
Ana-Sunćana Smith
Andreas Maier
Copyright-Jahr
2019
DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-658-25326-4_26