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2014 | OriginalPaper | Buchkapitel

SVM Tree for Personalized Transductive Learning in Bioinformatics Classification Problems

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Personalized modelling joint with Transductive Learning (PTL) uses a particular local modelling (personalized) around a single point for classification of each test sample, thus it is basically neighbourhood dependent. Usually existing PTL methods define the neighbourhood using a (dis)similarity measure, in this paper we propose a new transductive SVM classification tree (tSVMT) based on PTL. The neighbourhood of a test sample is built over the classification knowledge modelled by regional SVMs, and a set of such SVMs adjacent to the test sample are aggregated systematically into a tSVMT. Compared to a normal SVM/SVMT approach, the proposed tSVMT, with the aggregation of SVMs, improves classifying power in terms of accuracy on bioinformatics database. Moreover, tSVMT seems to solve the over-fitting problem of all previous SVMTs as it aggregates neighbourhood knowledge, significantly reducing the size of the SVM tree.

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Metadaten
Titel
SVM Tree for Personalized Transductive Learning in Bioinformatics Classification Problems
verfasst von
Maurizio Fiasché
Copyright-Jahr
2014
DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-04129-2_22