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2009 | OriginalPaper | Chapter

Sliding Window Abstraction for Infinite Markov Chains

Authors : Thomas A. Henzinger, Maria Mateescu, Verena Wolf

Published in: Computer Aided Verification

Publisher: Springer Berlin Heidelberg

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We present an on-the-fly abstraction technique for infinite-state continuous -time Markov chains. We consider Markov chains that are specified by a finite set of transition classes. Such models naturally represent biochemical reactions and therefore play an important role in the stochastic modeling of biological systems. We approximate the transient probability distributions at various time instances by solving a sequence of dynamically constructed abstract models, each depending on the previous one. Each abstract model is a finite Markov chain that represents the behavior of the original, infinite chain during a specific time interval. Our approach provides complete information about probability distributions, not just about individual parameters like the mean. The error of each abstraction can be computed, and the precision of the abstraction refined when desired. We implemented the algorithm and demonstrate its usefulness and efficiency on several case studies from systems biology.

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Metadata
Title
Sliding Window Abstraction for Infinite Markov Chains
Authors
Thomas A. Henzinger
Maria Mateescu
Verena Wolf
Copyright Year
2009
Publisher
Springer Berlin Heidelberg
DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-642-02658-4_27

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