Skip to main content

2021 | OriginalPaper | Buchkapitel

Current Situation and Prospect of EMDB/EMPIAR-China

verfasst von : Tongxin Niu, Yan Zhang, Jun Liu, Bo Zhang, Fei Sun

Erschienen in: China’s e-Science Blue Book 2020

Verlag: Springer Singapore

Aktivieren Sie unsere intelligente Suche, um passende Fachinhalte oder Patente zu finden.

search-config
loading …

Abstract

In recent years, cryo-electron microscopy technology has rapidly developed and become a key method in the structural biology field. Moreover, the number of people engaged in cryo-electron microscopy (cryo-EM) is increasing rapidly in China with attendant explosive growth in cryo-EM data. Therefore, to meet the academic demand for access to cryo-EM data and to promote the development of the structural biology field, the European Institute of Bioinformatics established the Electron Microscopy Data Bank (EMDB) in Europe. Furthermore, the Committee for the Study of Cryo-Electron Microscopy of the Chinese Society of Biophysics partnered with the European Bioinformatics Institute to establish a mirror site of the EMDB in China to aid researchers in conveniently uploading and downloading high-resolution electron microscopy data, to promote cryo-EM-related research efforts, and to enhance the international status of China’s basic research. This paper introduces aspects of the Chinese mirror website: the construction idea, structure, function realization, visualization tools, and running status. Furthermore, details of an analysis of the total visits to the website from the beginning of the website launch to October 30, 2019, are provided. Finally, future prospects of the Electron Microscope Database are assessed; briefly, we suggest it will play a crucial role in supporting and developing the field of structural biology.

Sie haben noch keine Lizenz? Dann Informieren Sie sich jetzt über unsere Produkte:

Springer Professional "Wirtschaft+Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft+Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 102.000 Bücher
  • über 537 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Nachhaltigkeit
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Maschinenbau + Werkstoffe
  • Versicherung + Risiko

Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Springer Professional "Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 67.000 Bücher
  • über 390 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Nachhaltigkeit
  • Maschinenbau + Werkstoffe




 

Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Springer Professional "Wirtschaft"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 67.000 Bücher
  • über 340 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Versicherung + Risiko




Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Literatur
1.
Zurück zum Zitat Lawson CL, Patwardhan A, Baker ML et al (2016) EMDataBank unified data resource for 3DEM[J]. Nucleic Acids Res 44(D1):D396–D403CrossRef Lawson CL, Patwardhan A, Baker ML et al (2016) EMDataBank unified data resource for 3DEM[J]. Nucleic Acids Res 44(D1):D396–D403CrossRef
2.
Zurück zum Zitat Iudin A et al (2016) EMPIAR: a public archive for raw electron microscopy image data. Nat Methods 13(5):387–388 Iudin A et al (2016) EMPIAR: a public archive for raw electron microscopy image data. Nat Methods 13(5):387–388
3.
Zurück zum Zitat Young JY et al (2017) OneDep: unified wwPDB system for deposition, biocuration, and validation of macromolecular structures in the PDB archive. Structure 25(3):536–545 Young JY et al (2017) OneDep: unified wwPDB system for deposition, biocuration, and validation of macromolecular structures in the PDB archive. Structure 25(3):536–545
5.
Zurück zum Zitat Lindstrom P (2014) Fixed-rate compressed floating-point arrays. IEEE Trans Vis Comput Gr 20(12):2674–2683CrossRef Lindstrom P (2014) Fixed-rate compressed floating-point arrays. IEEE Trans Vis Comput Gr 20(12):2674–2683CrossRef
6.
Zurück zum Zitat Jun L et al (2019) VASEM: visual analytics system for electron microscopy data bank. J Vis 22(6):1145–1159CrossRef Jun L et al (2019) VASEM: visual analytics system for electron microscopy data bank. J Vis 22(6):1145–1159CrossRef
Metadaten
Titel
Current Situation and Prospect of EMDB/EMPIAR-China
verfasst von
Tongxin Niu
Yan Zhang
Jun Liu
Bo Zhang
Fei Sun
Copyright-Jahr
2021
Verlag
Springer Singapore
DOI
https://doi.org/10.1007/978-981-15-8342-1_11

    Marktübersichten

    Die im Laufe eines Jahres in der „adhäsion“ veröffentlichten Marktübersichten helfen Anwendern verschiedenster Branchen, sich einen gezielten Überblick über Lieferantenangebote zu verschaffen.