Skip to main content
Fachgebiete
Automobil + Motoren Bauwesen + Immobilien Business IT + Informatik Elektrotechnik + Elektronik Energie + Nachhaltigkeit Finance + Banking Management + Führung Marketing + Vertrieb Maschinenbau + Werkstoffe Versicherung + Risiko
DE
EN
Bücher
Zeitschriften
Themenseiten
Organisationspsychologie Projektmanagement Marketing Smart Manufacturing
Weitere Formate
Podcasts Webinare Technik Webinare Wirtschaft Kongresse Veranstaltungskalender Awards
Jetzt Einzelzugang starten
Zugang für Unternehmen
Referenzkunden
SLX-Digitalkonferenz: Zukunftswerkstatt 2024

Mehr Umsatz mit Top-Kontakten

Am 7. Mai erfahren Sie, wie Vertriebsteams Leadgenerierung, Leadnurturing und Leadstrategien effizient steuern können.
Erweiterte Suche
Anmelden
nach oben
Erschienen in:
Unsupervised Integration of Single-Cell Multi-omics Datasets with Disproportionate Cell-Type Representation Kapitel lesen Erstes Kapitel lesen

2022 | OriginalPaper | Buchkapitel

ImmunoTyper-SR: A Novel Computational Approach for Genotyping Immunoglobulin Heavy Chain Variable Genes Using Short Read Data

verfasst von : Michael Ford, Ananth Hari, Oscar Rodriguez, Junyan Xu, Justin Lack, Cihan Oguz, Yu Zhang, Sarah Weber, Mary Magliocco, Jason Barnett, Sandhya Xirasagar, Smilee Samuel, Luisa Imberti, Paolo Bonfanti, Andrea Biondi, Clifton L. Dalgard, Stephen Chanock, Lindsey Rosen, Steven Holland, Helen Su, Luigi Notarangelo, Uzi Vishkin, Corey Watson, S. Cenk Sahinalp, SPS NIAID COVID Consortium

Erschienen in: Research in Computational Molecular Biology

Verlag: Springer International Publishing

Einloggen

Aktivieren Sie unsere intelligente Suche, um passende Fachinhalte oder Patente zu finden.

search-config
loading …

Abstract

The human immunoglobulin heavy chain (IGH) locus on chromosome 14 includes more than 40 functional copies of the variable gene (IGHV).

Sie haben noch keine Lizenz? Dann Informieren Sie sich jetzt über unsere Produkte:

Springer Professional "Wirtschaft+Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft+Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 102.000 Bücher
  • über 537 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Nachhaltigkeit
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Maschinenbau + Werkstoffe
  • Versicherung + Risiko

Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Jetzt informieren

Springer Professional "Technik"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Technik" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 67.000 Bücher
  • über 390 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Automobil + Motoren
  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Elektrotechnik + Elektronik
  • Energie + Nachhaltigkeit
  • Maschinenbau + Werkstoffe




 

Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Jetzt informieren

Springer Professional "Wirtschaft"

Online-Abonnement

Mit Springer Professional "Wirtschaft" erhalten Sie Zugriff auf:

  • über 67.000 Bücher
  • über 340 Zeitschriften

aus folgenden Fachgebieten:

  • Bauwesen + Immobilien
  • Business IT + Informatik
  • Finance + Banking
  • Management + Führung
  • Marketing + Vertrieb
  • Versicherung + Risiko




Jetzt Wissensvorsprung sichern!

Jetzt informieren
Vorheriges Kapitel Mapping Single-Cell Transcriptomes to Copy Number Evolutionary Trees
Nächstes Kapitel AutoComplete: Deep Learning-Based Phenotype Imputation for Large-Scale Biomedical Data
Literatur
1.
Yeung, Y.A., et al.: Germline-encoded neutralization of a staphylococcus aureus virulence factor by the human antibody repertoire. Nat. Commun. 7, 1–14 (2016)
2.
Lee, J.H., et al.: Vaccine genetics of IGHV1-2 VRC01-class broadly neutralizing antibody precursor naïve human b cells. NPJ Vaccines 6, 1–12 (2021)CrossRef
3.
Johnson, T.A., et al.: Association of an IGHV3-66 gene variant with Kawasaki disease. J. Hum. Genet. 66, 475–489 (2021)CrossRef
4.
Parks, T., et al.: Association between a common immunoglobulin heavy chain allele and rheumatic heart disease risk in Oceania. Nat. Commun. 8, 1–10 (2017)CrossRef
5.
Cui, M., et al.: Immunoglobulin expression in cancer cells and its critical roles in tumorigenesis. Front. Immunol. 12, 893 (2021)
6.
Watson, C.T., Glanville, J., Marasco, W.A.: The individual and population genetics of antibody immunity. Front. Immunol. 38, 459–470 (2017)
7.
8.
9.
Gadala-Maria, D., et al.: Identification of subject-specific immunoglobulin alleles from expressed repertoire sequencing data. Front. Immunol. 10, 129 (2019)
10.
Rodriguez, O.L., et al.: A Novel Framework for Characterizing Genomic Haplotype Diversity in the Human Immunoglobulin Heavy Chain Locus. Front. Immunol. 11, 1–16 (2020)CrossRef
11.
Luo, S., Yu, J.A., Song, Y.S.: Estimating copy number and allelic variation at the immunoglobulin heavy chain locus using short reads. PLoS Comput. Biol. 12, 1–21 (2016)CrossRef
12.
Luo, S., Jane, A.Y., Li, H., Song, Y.S.: Worldwide genetic variation of the IGHV and TRBV immune receptor gene families in humans. Life Sci. Alliance 2 (2019)
13.
1000-Genomes-Project-Consortium et al.: A global reference for human genetic variation. Nature 526, 68 (2015)
Metadaten
Titel
ImmunoTyper-SR: A Novel Computational Approach for Genotyping Immunoglobulin Heavy Chain Variable Genes Using Short Read Data
verfasst von
Michael Ford
Ananth Hari
Oscar Rodriguez
Junyan Xu
Justin Lack
Cihan Oguz
Yu Zhang
Sarah Weber
Mary Magliocco
Jason Barnett
Sandhya Xirasagar
Smilee Samuel
Luisa Imberti
Paolo Bonfanti
Andrea Biondi
Clifton L. Dalgard
Stephen Chanock
Lindsey Rosen
Steven Holland
Helen Su
Luigi Notarangelo
Uzi Vishkin
Corey Watson
S. Cenk Sahinalp
SPS NIAID COVID Consortium
Copyright-Jahr
2022
Buch
Research in Computational Molecular Biology

Print ISBN: 978-3-031-04748-0

Electronic ISBN: 978-3-031-04749-7

Copyright-Jahr: 2022

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-031-04749-7_37