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Erschienen in:
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2012 | OriginalPaper | Buchkapitel

Bma: Visual Tool for Modeling and Analyzing Biological Networks

verfasst von : David Benque, Sam Bourton, Caitlin Cockerton, Byron Cook, Jasmin Fisher, Samin Ishtiaq, Nir Piterman, Alex Taylor, Moshe Y. Vardi

Erschienen in: Computer Aided Verification

Verlag: Springer Berlin Heidelberg

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BioModel Analyzer (

bma

) is a tool for modeling and analyzing biological networks. Designed with a lightweight graphical user interface, the tool facilitates usage for biologists with no previous knowledge in programming or formal methods. The current implementation analyzes systems to establish stabilization. The results of the analysis—whether they be proofs or counterexamples—are represented visually. This paper describes the approach to modeling used in

bma

and also notes soon-to-be-released extensions to the tool.

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Metadaten
Titel
Bma: Visual Tool for Modeling and Analyzing Biological Networks
verfasst von
David Benque
Sam Bourton
Caitlin Cockerton
Byron Cook
Jasmin Fisher
Samin Ishtiaq
Nir Piterman
Alex Taylor
Moshe Y. Vardi
Copyright-Jahr
2012
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
Buch
Computer Aided Verification

Print ISBN: 978-3-642-31423-0

Electronic ISBN: 978-3-642-31424-7

Copyright-Jahr: 2012

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-642-31424-7_50