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2007 | OriginalPaper | Buchkapitel

Self-normalised Distance with Don’t Cares

verfasst von : Peter Clifford, Raphaël Clifford

Erschienen in: Combinatorial Pattern Matching

Verlag: Springer Berlin Heidelberg

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We present

O

(

n

log

m

) algorithms for a new class of problems termed

self-normalised distance with don’t cares

. The input is a pattern

p

of length

m

and text

t

of length

n

 > 

m

. The elements of these strings are either integers or wild card symbols. In the shift version, the problem is to compute

$\min_{\alpha}\sum_{j=0}^{m-1}(\alpha + p_j - t_{i+j})^2$

for all

i

, where wild cards do not contribute to the sum. In the shift-scale version, the objective is to compute

$\min_{\alpha,\beta}\sum_{j=0}^{m-1}(\alpha+ \beta p_j - t_{i+j})^2$

for all

i

, similarly. We show that the algorithms have the additional benefit of providing simple

O

(

n

log

m

) solutions for the problems of exact matching with don’t cares, exact shift matching with don’t cares and exact shift-scale matching with don’t cares.

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Metadaten
Titel
Self-normalised Distance with Don’t Cares
verfasst von
Peter Clifford
Raphaël Clifford
Copyright-Jahr
2007
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-540-73437-6_9

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