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2017 | OriginalPaper | Buchkapitel

Calculating Kolmogorov Complexity from the Transcriptome Data

verfasst von : Panpaki Seekaki, Norichika Ogata

Erschienen in: Intelligent Computing Theories and Application

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

Information entropy is used to summarize transcriptome data, but ignoring zero count data contained them. Ignoring zero count data causes loss of information and sometimes it was difficult to distinguish between multiple transcriptomes. Here, we estimate Kolmogorov complexity of transcriptome treating zero count data and distinguish similar transcriptome data.

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Metadaten
Titel
Calculating Kolmogorov Complexity from the Transcriptome Data
verfasst von
Panpaki Seekaki
Norichika Ogata
Copyright-Jahr
2017
Buch
Intelligent Computing Theories and Application

Print ISBN: 978-3-319-63311-4

Electronic ISBN: 978-3-319-63312-1

Copyright-Jahr: 2017

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-63312-1_46

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