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2011 | OriginalPaper | Buchkapitel

Graph-Theoretic Formalization of Hybridization in DNA Sticker Complexes

verfasst von : Robert Brijder, Joris J. M. Gillis, Jan Van den Bussche

Erschienen in: DNA Computing and Molecular Programming

Verlag: Springer Berlin Heidelberg

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Sticker complexes are a formal graph-based data model for a restricted class of DNA complexes, motivated by potential applications to databases. This data model allows for a purely declarative definition of hybridization. We introduce the notion of terminating hybridization, and characterize this notion in purely graph-theoretic terms. Terminating hybridization can still produce results of exponential size. We indicate a class of complexes where hybridization is guaranteed to be polynomially bounded.

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Metadaten
Titel
Graph-Theoretic Formalization of Hybridization in DNA Sticker Complexes
verfasst von
Robert Brijder
Joris J. M. Gillis
Jan Van den Bussche
Copyright-Jahr
2011
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
Buch
DNA Computing and Molecular Programming

Print ISBN: 978-3-642-23637-2

Electronic ISBN: 978-3-642-23638-9

Copyright-Jahr: 2011

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-642-23638-9_7

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