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2015 | OriginalPaper | Buchkapitel

Locating a Tree in a Phylogenetic Network in Quadratic Time

verfasst von : Philippe Gambette, Andreas D. M. Gunawan, Anthony Labarre, Stéphane Vialette, Louxin Zhang

Erschienen in: Research in Computational Molecular Biology

Verlag: Springer International Publishing

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A fundamental problem in the study of phylogenetic networks is to determine whether or not a given phylogenetic network contains a given phylogenetic tree. We develop a quadratic-time algorithm for this problem for binary nearly-stable phylogenetic networks. We also show that the number of reticulations in a reticulation visible or nearly stable phylogenetic network is bounded from above by a function linear in the number of taxa.

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Metadaten
Titel
Locating a Tree in a Phylogenetic Network in Quadratic Time
verfasst von
Philippe Gambette
Andreas D. M. Gunawan
Anthony Labarre
Stéphane Vialette
Louxin Zhang
Copyright-Jahr
2015
Buch
Research in Computational Molecular Biology

Print ISBN: 978-3-319-16705-3

Electronic ISBN: 978-3-319-16706-0

Copyright-Jahr: 2015

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-16706-0_12