Modellierung und Simulation von Protein-Interaktionen am Beispiel von Wirts-Pathogen-Interaktionen

verfasst von: Meik Kunz

Verlag: Springer Fachmedien Wiesbaden

Buchreihe : BestMasters

Enthalten in: Springer Professional "Wirtschaft+Technik" , Springer Professional "Technik" , Springer Professional "Wirtschaft"

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Über dieses Buch

Meik Kunz erforscht die Interaktion zwischen den Wachstumshormonen Cytokinin und Auxin und untersucht deren Zusammenspiel im Hinblick auf die pflanzliche Immunabwehr. Der Autor zeigt zudem mittels einer eigens entwickelten Methode die Möglichkeit auf, wie in einer Transkriptom-Interaktom-Analyse zentrale funktionelle Netzwerkknoten (sogenannte Hubproteine) einer Cytokinin-vermittelten Immunabwehr identifiziert werden können. Begleitend wurde eine für den Forschungsalltag zugeschnittene Datenbank zur Analyse von Protein-Interaktionen erstellt.

Inhaltsverzeichnis

Frontmatter

Chapter 1. Einleitung

Zusammenfassung

Die Sicherung von Nahrung ist ein immer bedeutender werdendes Problem, mit welchem die wachsende menschliche Gesellschaft konfrontiert ist (FAO. http://www.fao.org/publications/sofi/en/). Naturkatastrophen verändern die soziodemografische Dynamik der ländlichen Bevölkerung erheblich und zeigen eine Wirkung auf den Ackerbau (Hansen, Sato et al. 2012).

Meik Kunz

Chapter 2. Material und Methoden

Zusammenfassung

Um die Interaktion zwischen CK und AUX zu untersuchen, wurde zuerst ein Wirts-Pathogen-Netzwerk unter Verwendung verschiedener Interaktom-DBen sowie Literaturrecherche rekonstruiert, wobei sich hierbei auf eine Infektion von A. thaliana mit Pst DC 3000 fokussiert wurde. Hierzu wurden Informationen zu Enzymen und deren Interaktionen aus den DBen KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes; http://www.genome.jp/kegg/) und PMN (Plant Metabolic Networks; http://www.plantcyc.org/) verwendet.

Meik Kunz

Chapter 3. Ergebnisse

Zusammenfassung

Unter Verwendung verschiedener Interaktom-DBen sowie Literaturrecherche (siehe 4.1) wurde ein Wirts-Pathogen-Netzwerk erstellt (Abb. 6).

Meik Kunz

Chapter 4. Diskussion

Zusammenfassung

Hormon-Interaktionen, z.B. eine antagonistische Interaktion zwischen SA und JA/ET (Verhage, van Wees et al. 2010), bilden das Immunsystem von Pflanzen. SA aktiviert wiederum die Expression von PR1, einem Marker für die Immunabwehr, und verhilft ihnen so, sich vor Infektionen zu schützen (Grant and Jones 2009, Robert-Seilaniantz, Grant et al. 2011, Sano, Seo et al. 1994). Um die Anfälligkeit des Wirts zu erhöhen, stellen diese Hormone gleichzeitig gezielt Angriffspunkte von Pathogenen dar.

Meik Kunz

Backmatter

Titel: Modellierung und Simulation von Protein-Interaktionen am Beispiel von Wirts-Pathogen-Interaktionen
verfasst von: Meik Kunz
Verlag: Springer Fachmedien Wiesbaden
Electronic ISBN: 978-3-658-16778-3
Print ISBN: 978-3-658-16777-6
DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-658-16778-3