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2018 | OriginalPaper | Buchkapitel

Estimating Tropical Principal Components Using Metropolis Hasting Algorithm

verfasst von : Qiwen Kang, Ruriko Yoshida

Erschienen in: Mathematical Software – ICMS 2018

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

Principal component analysis is one of the most popular unsupervised learning methods for reducing the dimension of a given data set in a high-dimensional Euclidean space. However, computing principal components on a space of phylogenetic trees with fixed labels of leaves is a challenging task since a space of phylogenetic tree is not Euclidean. In 2017, Yoshida et al. defined a notion of tropical principal component analysis and they have applied it to a space of phylogenetic trees. The challenge, however, they encountered was a computational times.
In this paper we estimate tropical principal components in a space of phylogenetic trees using the Metropolis-Hasting algorithm. We have implemented an R software package to efficiently estimate tropical principal components and then we have applied it to African coelacanth genomes data set.

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Literatur
1.
Akian, M., Gaubert, S., Viorel, N., Singer, I.: Best approximation in max-plus semimodules. Linear Algebra Appl. 435, 3261–3296 (2011)MathSciNetCrossRef
2.
Ardila, F., Klivans, C.: The Bergman complex of a matroid and phylogenetic trees. J. Comb. Theory Ser. B 96, 38–49 (2006)MathSciNetCrossRef
3.
Billera, L., Holmes, S., Vogtman, K.: Geometry of the space of phylogenetic trees. Adv. Appl. Math. 27, 733–767 (2001)MathSciNetCrossRef
4.
Cohen, G., Gaubert, S., Quadrat, J.P.: Duality and separation theorems in idempotent semimodules. Linear Algebra Appl. 379, 395–422 (2004)MathSciNetCrossRef
5.
Hedges, S.B.: Vertebrates (Vertebrata). In: Hedges, S.B., Kumar, S. (eds.) The Timetree of Life, pp. 309–314. Oxford University Press (2009)
6.
7.
Levine, N.D.: Progress in taxonomy of the Apicomplexan protozoa. J. Eukaryot Microbiol. 35, 518–520 (1988)
8.
Liang, D., Shen, X.X., Zhang, P.: One thousand two hundred ninety nuclear genes from a genome-wide survey support lungfishes as the sister group of tetrapods. Mol. Biol. Evol. 8, 1803–1807 (2013)CrossRef
9.
Lin, B., Sturmfels, B., Tang, X., Yoshida, R.: Convexity in tree spaces. SIAM Discrete Math. 3, 2015–2038 (2017)MathSciNetCrossRef
10.
Maclagan, D., Sturmfels, B.: Introduction to Tropical Geometry, Graduate Studies in Mathematics, vol. 161. American Mathematical Society, Providence (2015)CrossRef
11.
12.
Pachter, L., Sturmfels, B.: Algebraic Statistics for Computational Biology. Cambridge University Press, New York (2005)CrossRef
13.
14.
Metadaten
Titel
Estimating Tropical Principal Components Using Metropolis Hasting Algorithm
verfasst von
Qiwen Kang
Ruriko Yoshida
Copyright-Jahr
2018
Buch
Mathematical Software – ICMS 2018

Print ISBN: 978-3-319-96417-1

Electronic ISBN: 978-3-319-96418-8

Copyright-Jahr: 2018

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-96418-8_32

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