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2015 | OriginalPaper | Buchkapitel

10. Analysis of Biological Networks

verfasst von : K. Erciyes

Erschienen in: Distributed and Sequential Algorithms for Bioinformatics

Verlag: Springer International Publishing

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Abstract

Biological processes such as the interaction between proteins or metabolic reactions can be represented by networks which can be modeled by graphs. Biological networks are present in the cell and outside the cell. Our aim in this chapter is to first introduce the networks in the cell and analyze them as graphs. Centrality analysis provides information about the important nodes and edges in biological networks and we describe algorithms to find various centrality measures. The main problems to investigate in the graph structure of a biological network are the module detection, discovery of recurrent subgraphs called network motifs and aligning two or more networks as we discuss. We will see these networks have interesting features such as small-world, scale-free properties which are not found in random networks. All of these problems are discussed in detail in the rest of this part of the book.

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Metadaten
Titel
Analysis of Biological Networks
verfasst von
K. Erciyes
Copyright-Jahr
2015
Buch
Distributed and Sequential Algorithms for Bioinformatics

Print ISBN: 978-3-319-24964-3

Electronic ISBN: 978-3-319-24966-7

Copyright-Jahr: 2015

DOI
https://doi.org/10.1007/978-3-319-24966-7_10

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